CN116134150A 病原体特异性核酸片段及其应用
申请日:2021.09.16
IPC分类号:C12Q1/68
公开日:20230516
申请人:南京迈西可生物科技有限公司
发明人:陈奇涵;王强
病原体特异性核酸片段及其应用
提供了多种病原体特异性核酸片段。还提供了鉴定一种或多种病原体的方法,包括:1)提供可能包括所述病原体的样品;以及2)检测所述样品中是否存在病原体特异性核酸片段或者检测所述样品中病原体特异性核酸片段的含量,其中所述病原体特异性核酸片段是否存在或其含量分别反映与所述病原体特异性核酸片段对应的病原体在所述样品中的是否存在或其含量。提供的病原体特异性核酸片段可用于对病原体进行快速鉴定,在临床上应用时阳性检出率高,检测周期短。
申请号:CN202180063353.4
公开(公告)号:CN116134150A
申请日:2021.09.16
公开(公告)日:20230516
优先权:20200916 CN PCT/CN2020/115682
同族:中国$美国$世界知识产权组织(WIPO)
同族引用文献:7
同族施引专利:0
申请人:南京迈西可生物科技有限公司
申请人地址:210000 江苏省南京市栖霞区仙林街道仙林大学城纬地路9号F7栋640室
权利人:南京迈西可生物科技有限公司
权利人地址:210000 江苏省南京市栖霞区仙林街道仙林大学城纬地路9号F7栋640室
发明人:陈奇涵;王强
代理机构:北京华睿卓成知识产权代理事务所(普通合伙)
代理人:程淼$刘海
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鉴定一种或多种病原体的方法,包括:
1)提供可能包括所述病原体的样品;以及
2)检测所述样品中是否存在病原体特异性核酸片段或者检测所述样品中病原体特异性核酸片段的含量,
其中与鲍曼不动杆菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:34-49中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与大肠杆菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:50-221中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与肺炎克雷伯氏菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:222-542中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与金黄色葡萄球菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:543-601中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与铜绿假单胞菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:602-896中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与表皮葡萄球菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:897-1079中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与头状葡萄球菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:1080-1169中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与粪肠球菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:1170-1279中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与屎肠球菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:1280-1405中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与嗜麦芽窄食单胞菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:1406-1550中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与结核分枝杆菌、非洲分枝杆菌、或牛分枝杆菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:1551-1590中任一序列的至少一部分,或其互补序列,
其中所述病原体特异性核酸片段是否存在或其含量分别反映与所述病原体特异性核酸片段对应的病原体在所述样品中的是否存在或其含量。
分离的核酸分子,包括SEQ ID NO:34-1590中任一序列的至少一部分,或其互补序列。
用于在样品中检测病原体的试剂盒,包括
1)用于对所述样品中的病原体特异性核酸片段进行扩增以产生扩增产物的引物;以及
2)具有反式切割活性的Crispr/Cas家族核酸酶,以所述扩增产物的至少部分序列作为靶序列的crRNA,和在5’和3’末端分别带有荧光基团和淬灭基团的单链DNA报告分子,其中
与鲍曼不动杆菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:34-49中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与大肠杆菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:50-221中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与肺炎克雷伯氏菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:222-542中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与金黄色葡萄球菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:543-601中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与铜绿假单胞菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:602-896中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与表皮葡萄球菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:897-1079中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与头状葡萄球菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:1080-1169中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与粪肠球菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:1170-1279中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与屎肠球菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:1280-1405中任一序列的至少一部分,或其互补序列;
与嗜麦芽窄食单胞菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:1406-1550中任一序列的至少一部分,或其互补序列;以及
与结核分枝杆菌、非洲分枝杆菌或牛分枝杆菌对应的病原体特异性核酸片段选自SEQ ID NO:1551-1590中任一序列的至少一部分,或其互补序列。

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